Genexpressie-assay nuttig voor vroegdetectie van virale luchtweginfecties

Delen via:

Met transcriptionele biomarkers is het mogelijk om luchtweginfecties met diverse virale oorzaken en ziektestadia nauwkeurig vast te stellen. Op basis hiervan kan vroegtijdig een effectieve behandeling gestart worden of kan de patiënt indien nodig in quarantaine gaan. Deze inzichten zijn waardevol in de setting van endemische en pandemische infectieziekten.

Uitbraken van virale infecties blijven een mondiaal probleem. Voorbeelden zijn uitbraken van mazelen, de pandemische uitbraak van influenza A H1N1 in 2009 en de opkomst van nieuwe coronavirussen in 2003 en 2012 en momenteel van SARS-CoV-2. Het is essentieel, zowel voor de behandeling van de patiënt zelf, als voor de volksgezondheid, om dergelijke virale luchtweginfecties vroeg en nauwkeurig vast te kunnen stellen.

Beperkingen van traditionele diagnostiek

Er zijn weinig moleculaire tools die geschikt zijn in het onderzoek van uitbraken of als leidraad voor een vroege behandeling. De traditionele diagnostische methoden die gericht zijn op pathogenen (bijv. kweek, serologie, antigeendetectie en PCR), kennen meerdere beperkingen. Ten eerste kunnen ze traag en duur zijn en weinig pathogenen detecteren. Verder kan het nodig zijn om kennis te hebben over de te testen ziekteverwekker. Met de traditionele methoden worden mogelijk geen nieuwe stammen gedetecteerd, zoals de influenza A H1N1 uit 2009 en het huidige pandemische SARS-CoV-2-virus. Bovendien kunnen deze methoden vaak geen onderscheid maken tussen een actieve infectie en kolonisatie.

Transcriptomische biomarkers

In deze prospectieve indexclusterstudie, die verscheen in The Lancet. Infectious Diseases, is gedurende een periode van 5 jaar in de Duke University (Durham, Verenigde Staten) een cohort van 1465 studenten gerekruteerd. Om indexgevallen te identificeren, volgden de onderzoekers studenten op de aanwezigheid en ernst van 8 symptomen van luchtweginfecties. In een online enquête werden de symptomen beoordeeld op een schaal van 0-4.

De indexgevallen rapporteerden volgens de gebruikte definitie een stijging van 6 punten van de cumulatieve dagelijkse symptoomscore. Verdachte indexgevallen werden bezocht door een onderzoeker, om de aanwezigheid van de gerapporteerde ziektesymptomen te bevestigen en om monsters te verzamelen. Van de 264 indexgevallen met symptomen van een luchtweginfectie werd bij 150 personen (57%) een virale oorzaak bevestigd middels een RT-PCR-test.

Nauwe contacten

Vervolgens zijn clusters van nauwe contacten van indexgevallen vastgesteld, die een verhoogd risico hadden op een symptomatische luchtweginfectie. 106 van de 555 nauwe contacten (19%) ontwikkelden gedurende de observatieperiode van 5 dagen een symptomatische luchtweginfectie met een bewezen virale oorzaak. 60 nauwe contacten (57%) hadden hetzelfde virus als hun geassocieerde indexgeval. In totaal werden 9 virussen gedetecteerd.

De transcriptomische assay gaf een nauwkeurige voorspelling van de virale infectie, indien de symptomen het ernstigste waren. De voorspelling was ook nauwkeurig in de 3 dagen daarvoor. In die periode waren de symptomen minimaal of afwezig en werd in veel gevallen (62-82%) geen virale shedding gevonden.

Eerste karakterisering

Voor zover bekend is in deze studie voor de eerste keer de presymptomatische en temporele dynamiek van transcriptomische biomarkers van de gastheer gekarakteriseerd in reactie op virale infecties bij mensen.

Bron:

McClain MT, Constantine FJ, Nicholson BP, et al. A blood-based host gene expression assay for early detection of respiratory viral infection: an index-cluster prospective cohort study. Lancet Infect Dis. 2021;21:396-404.

Colchicine voor poliklinisch behandelde COVID-19-patiënten

okt 2021 | Virale infecties

Lees meer over Colchicine voor poliklinisch behandelde COVID-19-patiënten

Verandering in gevoeligheid speeksel-PCR-test tijdens SARS-CoV-2-infectie

okt 2021 | Pneumonie, Virale infecties

Lees meer over Verandering in gevoeligheid speeksel-PCR-test tijdens SARS-CoV-2-infectie

Amsterdamse analyse toont dat COVID-19-gerelateerd ARDS heterogeen is

okt 2021 | Pneumonie, Virale infecties

Lees meer over Amsterdamse analyse toont dat COVID-19-gerelateerd ARDS heterogeen is

Speeksel versus nasofaryngeale uitstrijk voor detectie SARS-CoV-2

okt 2021 | Pneumonie, Virale infecties

Lees meer over Speeksel versus nasofaryngeale uitstrijk voor detectie SARS-CoV-2

Maternale kinkhoestvaccinaties in de regio Amsterdam

okt 2021 | Kinderen, Vaccinatie

Lees meer over Maternale kinkhoestvaccinaties in de regio Amsterdam

De rol van het contactsysteem bij pneumonie en sepsis

okt 2021 | Bacteriële infecties, Pneumonie

Lees meer over De rol van het contactsysteem bij pneumonie en sepsis

Live webcast Long covid: wat weten we, wat kunt u verwachten, wat kunt u doen?

10 nov 2021 om 20:30

Lees meer over Live webcast Long covid: wat weten we, wat kunt u verwachten, wat kunt u doen?

The ART of Preventing Kidney Damage

12 apr 2021 om 20:00 | HIV, Virale infecties

Lees meer over The ART of Preventing Kidney Damage

Stollingsafwijkingen bij COVID-19; behandeling op de IC

30 nov 2020 om 20:30 | Benigne hematologie, Virale infecties

Lees meer over Stollingsafwijkingen bij COVID-19; behandeling op de IC

Precisiezorg dichterbij dan we denken

2 nov 2020

Lees meer over Precisiezorg dichterbij dan we denken
Er zijn geen e-learnings gevonden.
Er zijn geen bijeenkomsten gevonden.

Interactie tussen fecestransplantatie en eradicatie van resistente bacteriën blootgelegd

Lees meer
Lees meer over Interactie tussen fecestransplantatie en eradicatie van resistente bacteriën blootgelegd

Nieuwe data uit analyse van 60 studies naar de relatie tussen COVID-19 en diabetes

Lees meer
Lees meer over Nieuwe data uit analyse van 60 studies naar de relatie tussen COVID-19 en diabetes

COVID-19 verandert de functie van insulineproducerende bètacellen

Lees meer
Lees meer over COVID-19 verandert de functie van insulineproducerende bètacellen

Zorgelijk: het aantal klassieke soa-diagnoses neemt toe

Lees meer
Lees meer over Zorgelijk: het aantal klassieke soa-diagnoses neemt toe

Long-COVID heeft nadelige impact op overleving kankerpatiënten

Lees meer
Lees meer over Long-COVID heeft nadelige impact op overleving kankerpatiënten

Budesonide verlaagt zorggebruik bij vroeg stadium COVID-19

Lees meer
Lees meer over Budesonide verlaagt zorggebruik bij vroeg stadium COVID-19

Schimmels en enterobacteriën geven slechte uitkomst bij bronchiëctasieën

Lees meer
Lees meer over Schimmels en enterobacteriën geven slechte uitkomst bij bronchiëctasieën

Prevalentie onvruchtbaarheid is verdubbeld bij hoge antistoftiter tegen chlamydia

Lees meer
Lees meer over Prevalentie onvruchtbaarheid is verdubbeld bij hoge antistoftiter tegen chlamydia

Toename resistentie azitromycine vraagt om monitoring

Lees meer
Lees meer over Toename resistentie azitromycine vraagt om monitoring

Innovatie in de zorg

nov 2019

Lees meer over Innovatie in de zorg