Het SQUEEZE-project naar biomarkers die het effect van medicatie bij reumapatiënten kunnen optimaliseren ontvangt ruim 10 miljoen euro uit het Horizon Europe programma. Het LUMC ontvangt ongeveer 1,2 miljoen.
Een van de biomarkers is een virus, het torque teno virus (TTV), een onschuldig virus dat iedereen bij zich draagt. Recent onderzoek heeft laten zien dat de hoeveelheid TTV die in bloed wordt gemeten het functioneren van het afweersysteem weerspiegelt. Reumapatiënten hebben vaak immuunsuppressiva nodig; helaas verschilt het effect van deze medicatie nogal van patiënt tot patiënt.
Door nu bij elke patiënt het TTV-niveau te meten, kan een beeld worden gekregen van de mate van afweeronderdrukking, en daarmee een indicatie of aanpassing van de dosering of van het type medicatie nodig is. Voor dit doel zullen de onderzoekers bij de afdeling Medische Microbiologie duizenden samples afkomstig van diverse Europese reumacentra betrokken bij SQUEEZE gaan testen met een TTV-PCR.
Het analyseren van alle data is een uitdaging. Hiervoor hebben de onderzoekers 2 oplossingen. Allereerst maken ze gebruik van de digitale werkomgeving anDREa, waarmee het toegankelijk maken en co-analyseren van data tussen verschillende centra makkelijker wordt. Ook zullen ze de federated learning approach verder uitwerken. Hiermee worden modellen getraind zonder dat alle data op dezelfde plek aanwezig is.
Bron: