Tijdens zijn PhD-onderzoek dook microbioloog Niels Plomp in bacteriestammen die worden geassocieerd met inflammatoire darmziekten (IBD). Hij promoveerde eind 2025 aan het UMCG onder begeleiding van dr. Hermie Harmsen en prof. Klaas Faber.
Plomp ontwikkelde een methode en databank om darmbacteriën efficiënt te isoleren en identificeren. In zijn proefschrift beschrijft de onderzoeker IBD-geassocieerde stamverschillen die de optie geven om te overleven in uiteenlopende darmomstandigheden. Mogelijk spelen ze een rol bij de beïnvloeding van de darmbarrièrefunctie.
Met behulp van de dataset beschreef Plomp de nieuwe bacteriesoort Faecalibacterium wellingii, die extracellulaire polymeersubstantie (EPS) produceert. EPS stimuleert de groei van darmepitheelcellen en expressie van genen die betrokken zijn bij hun barrièrefunctie. IBD-geassocieerde stammen van F. wellingii bleken toleranter tegenover zuurstof en reactieve zuurstofsoorten. Ook bezaten ze meer kopieën van genen die betrokken zijn bij oxidatieve stress.
Plomp onderzocht ook de wereldwijde distributie van Mediterraneibacter gnavus. In verwesterde samenlevingen blijkt de bacteriesoort frequenter en in hogere mate aanwezig. De onderzoeker zette een genoomsequentiecollectie op waarmee hij genen identificeerde die specifiek zijn voor mensen met de ziekte van Crohn.
De onderzoeker concludeert dat stamverschillen in M. gnavus en in verschillende soorten Faecalibacterium in verband kunnen worden gebracht met IBD. Stamverschillen erkennen draagt mogelijk bij aan betere therapeutische toepassingen.
Bron: