Whole-omics modellen voorspellen de respons op enzalutamide en abirateron bij patiënten met mCRPC

Delen via:

Bij patiënten met gemetastaseerd, castratieresistent prostaatcarcinoom is dringend behoefte aan biomarkers die de respons op behandeling met remmers van de androgeenreceptorsignalering kunnen voorspellen. Uit recent gepubliceerd onderzoek van Nederlandse en Amerikaanse onderzoekers blijkt nu dat modellen op basis van baseline whole-genomics of whole-transcriptomics van tumorweefsel in combinatie met informatie over eventueel toegepaste eerdere behandellijnen, adequaat de behandelduur en algehele overleving met enzalutamide of abirateron kunnen voorspellen.

Remmers van de androgeenreceptorsignalering (ARSI’s), waaronder enzalutamide en abirateron, hebben de prognose bij patiënten met gemetastaseerd, castratieresistent prostaatcarcinoom (mCRPC) aanzienlijk verbeterd. Toch varieert de respons tussen patiënten met mCRPC aanzienlijk en daarom is men naarstig op zoek naar predictieve biomarkers.

Strategie

In een recentelijk in Nature Communications gepubliceerde studie evalueerden onderzoekers van het Erasmus MC (Rotterdam), UMC Utrecht en de Universiteit van California in San Francisco (UCSF; Verenigde Staten) de voorspellende waarde van klinische gegevens in combinatie met de resultaten van whole genome sequencing (WGS; n = 155) en/of whole transcriptome sequencing (WTS; n = 113) op metastasen van patiënten met mCRPC die behandeld werden met enzalutamide of abirateron plus prednison. Machine learning werd toegepast om verschillende predictieve modellen te trainen en valideren aan de hand van de resultaten van een intern (CPCT-02) en extern (WCDT) cohort van patiënten met mCRPC. Hierbij werd het predictief vermogen in CPCT-02 en WCDT bepaald op grond van respectievelijk de behandelduur en de algehele overleving.  

Predictie

Uit analyse van het CPTC-cohort bleek dat op baseline tumor mutational burden (TMB; q < 0,001), structurele varianten (SV’s; q < 0,05), tandemduplicaties (q < 0,05) en deleties (q < 0,05) vaker voorkwamen bij patiënten met een slechte respons dan bij patiënten met een goede respons. Bovendien kwamen 151 genen verschillend tot expressie bij patiënten met een goede en slechte respons.

Vervolgens bleek uit de training en validatie van verschillende predictieve modellen op het interne en externe mCRPC-cohort dat een model op basis van WGS dan wel WTS in combinatie met wel of geen eerdere behandeling met een ARSI de respons het beste voorspelde. Ten slotte liet een aanvullende analyse zien dat ook een model gebaseerd op de TMB in whole exome-sequenties gecombineerd met eerder ARSI-gebruik voorspellende waarde had.

Bron:

De Jong AC, Danyi A, Van Riet J, et al. Predicting response to enzalutamide and abiraterone in metastatic prostate cancer using whole-omics machine learning. Nat Commun. 2023;14:1968.

Commentaar van eerste auteur Anouk de Jong, promovendus Erasmus MC, Rotterdam

“Het gebruik van voorspellende biomarkers bij patiënten met kanker kan leiden tot een betere respons, minder toxiciteit en besparing van kosten. Hoewel er bij patiënten met mCRPC verschillende voorspellende biomarkers gekarakteriseerd zijn, zoals het prostaatspecifiek antigeen (PSA) en androgeenreceptorvariant 7 (AR-v7), is de toepasbaarheid van deze markers niet eenduidig. In onze huidige studie onderzochten we of er met WGS en WTS van metastasen nieuwe biomarkers geïdentificeerd kunnen worden die een betere voorspellende waarde hebben. Hiervoor gebruikten we de WGS- en WTS-resultaten van 155 patiënten met mCRPC die in de eerste of latere lijn met ARSI’s behandeld werden en deelnamen aan de CPCT-02-studie. Van deze resultaten werd 70% gebruikt om via machine learning onze predictiemodellen te trainen en 30% om de modellen te valideren. Voor de validatie in een extern cohort gebruikten we de WGS- en WTS-resultaten van het WCDT-cohort van de UCSF.

“Uit onze WGS-analyses bleek dat een hoge TMB en een hoge incidentie van SV’s, tandemduplicaties en deleties significant geassocieerd waren met een slechte respons op ARSI’s. Hoewel we geen significante associatie zagen tussen de respons en genetische afwijkingen in individuele genen, waren er wel verschillen in de transcriptieprofielen van goede en slechte responders. Toen we deze resultaten gebruikten om verschillende predictiemodellen te ontwerpen, trainen en valideren, bleek dat 1 model op basis van WGS-resultaten in combinatie met eerder ARSI-gebruik en 1 model op basis van WTS-resultaten plus eerder ARSI-gebruik het beste presteerden in zowel het CPCT-02-cohort als het WCDT-cohort. Samengevat is onze conclusie dat je zowel op basis van DNA als RNA een respons op ARSI’s kunt voorspellen, waarbij beide strategieën voor- en nadelen hebben. Zo is het sequencen van RNA momenteel wat goedkoper dan het sequencen van DNA, maar is alleen laatstgenoemde methode geschikt om circulerend tumor-DNA te analyseren. Het mooiste zou natuurlijk zijn als dit soort op machine learning gebaseerde predictiemodellen toegepast kunnen worden op minimaal invasieve liquid biopsies. Een belangrijke vraag die nu in prospectief onderzoek beantwoord moet worden, is of een modelgestuurde behandeling ook daadwerkelijk leidt tot een verbeterde klinische uitkomst.”

Verhoogd risico op cutane tumoren bij mycosis fungoides

okt 2024 | Dermato-oncologie, Lymfoom

Lees meer over Verhoogd risico op cutane tumoren bij mycosis fungoides

Nieuwe strategieën om de respons op taxaanbehandeling bij uitgezaaide prostaatkanker te verlengen

okt 2024 | Uro-oncologie

Lees meer over Nieuwe strategieën om de respons op taxaanbehandeling bij uitgezaaide prostaatkanker te verlengen

Onderzoek naar lymfekliermetastasen bij baarmoederhalskanker

okt 2024 | Gynaecologische oncologie

Lees meer over Onderzoek naar lymfekliermetastasen bij baarmoederhalskanker

Dendritische celvaccinatie veelbelovend bij patiënten met resectabel pancreascarcinoom

okt 2024 | Maag-darm-leveroncologie

Lees meer over Dendritische celvaccinatie veelbelovend bij patiënten met resectabel pancreascarcinoom

Veelbelovende nieuwe immuuntherapie tegen kanker

okt 2024 | Immuuntherapie, Lymfoom

Lees meer over Veelbelovende nieuwe immuuntherapie tegen kanker

Platinagebaseerde chemotherapie plus pembrolizumab of nivolumab-ipilimumab bij NSCLC

okt 2024 | Immuuntherapie, Longoncologie

Lees meer over Platinagebaseerde chemotherapie plus pembrolizumab of nivolumab-ipilimumab bij NSCLC

Recent advances in the use of CAR T-cell therapies in relapsed/refractory diffuse large B-cell lymphoma and follicular lymphoma

1 okt 2024 om 12:00 | Lymfoom

Lees meer over Recent advances in the use of CAR T-cell therapies in relapsed/refractory diffuse large B-cell lymphoma and follicular lymphoma

Opioïden in de 2e lijn: Sleutels tot effectieve bestrijding van maligne pijn

10 sep 2024 om 20:00

Lees meer over Opioïden in de 2e lijn: Sleutels tot effectieve bestrijding van maligne pijn

Pakketbeslissingen en (on-)zekere kosteneffectiviteit: Willingness to Pay voor geneesmiddelen

1 jul 2024

Lees meer over Pakketbeslissingen en (on-)zekere kosteneffectiviteit: Willingness to Pay voor geneesmiddelen

Challenges in advanced Cutaneous T-cell Lymphoma (CTCL) – diagnosis and management

10 jun 2024 om 16:30 | Lymfoom

Lees meer over Challenges in advanced Cutaneous T-cell Lymphoma (CTCL) – diagnosis and management

Keynote webinar: Spotlight on antibody–drug conjugates in cancer

19 feb 2024 om 17:30 | Borstkanker

Lees meer over Keynote webinar: Spotlight on antibody–drug conjugates in cancer

Prostaatkanker nu en in de toekomst

25 jan 2024 | Uro-oncologie

Lees meer over Prostaatkanker nu en in de toekomst

Niet-melanoom huidkanker in de regio

31 aug 2023 | Dermato-oncologie, Radiotherapie

Lees meer over Niet-melanoom huidkanker in de regio

Keynote Webinar | Spotlight on Cardio-Oncology

16 mei 2023 om 17:30

Lees meer over Keynote Webinar | Spotlight on Cardio-Oncology

Borstkanker; een update op alle vlakken

9 mei 2023 om 20:00 | Borstkanker, Neuro-oncologie

Lees meer over Borstkanker; een update op alle vlakken

Immuno-oncologie module 1: immunologie en immuuntherapie

Lees meer over Immuno-oncologie module 1: immunologie en immuuntherapie

Immuno-oncologie module 2: Bijwerkingenmanagement en checkpoint inhibitors

Lees meer over Immuno-oncologie module 2: Bijwerkingenmanagement en checkpoint inhibitors

Immuno-oncologie module 3: Verpleegkundige casuïstiek

Lees meer over Immuno-oncologie module 3: Verpleegkundige casuïstiek
Er zijn geen bijeenkomsten gevonden.

Melanoom in vroeg stadium op het spoor

okt 2024 | Dermato-oncologie

Lees meer over Melanoom in vroeg stadium op het spoor

Melanoom snel in beeld met kunstmatige intelligentie

sep 2024 | Dermato-oncologie

Lees meer over Melanoom snel in beeld met kunstmatige intelligentie

Trastuzumab-deruxtecan bij gevorderde HER2+ borstkanker met hersenmetastasen

sep 2024 | Borstkanker

Lees meer over Trastuzumab-deruxtecan bij gevorderde HER2+ borstkanker met hersenmetastasen

PRMT5-remmer AMG 193 bij solide tumoren met MTAP-deletie

sep 2024 | Longoncologie, Maag-darm-leveroncologie

Lees meer over PRMT5-remmer AMG 193 bij solide tumoren met MTAP-deletie

BCMA bispecifieke middelen en CAR T-celtherapie bij MM in de praktijk

sep 2024 | MM

Lees meer over BCMA bispecifieke middelen en CAR T-celtherapie bij MM in de praktijk

Triple-B: carboplatine-cyclofosfamide versus paclitaxel met of zonder atezolizumab bij mTNBC

sep 2024 | Borstkanker

Lees meer over Triple-B: carboplatine-cyclofosfamide versus paclitaxel met of zonder atezolizumab bij mTNBC

Niet-operatief management optie bij pMMR lokaal gevorderd rectumcarcinoom na complete respons

sep 2024 | Maag-darm-leveroncologie

Lees meer over Niet-operatief management optie bij pMMR lokaal gevorderd rectumcarcinoom na complete respons

Het overwinnen van resistentie tegen PD-(L)1-remmers bij NSCLC

sep 2024 | Longoncologie

Lees meer over Het overwinnen van resistentie tegen PD-(L)1-remmers bij NSCLC

AI-model kan tumormutaties op basis van pathologiebeelden voorspellen

sep 2024

Lees meer over AI-model kan tumormutaties op basis van pathologiebeelden voorspellen

Podcast: EGFR ex20ins gemuteerd NSCLC in de dagelijkse klinische praktijk

feb 2024 | Longoncologie

Lees meer over Podcast: EGFR ex20ins gemuteerd NSCLC in de dagelijkse klinische praktijk

Podcast: Progress in PARP inhibitors - An exciting option for treating metastatic prostate cancer?

dec 2023 | Uro-oncologie

Lees meer over Podcast: Progress in PARP inhibitors - An exciting option for treating metastatic prostate cancer?

Podcast pancreascarcinoom

dec 2022 | Maag-darm-leveroncologie

Lees meer over Podcast pancreascarcinoom

Slokdarm- en maagkanker

jun 2021 | Chirurgie, Maag-darm-leveroncologie

Lees meer over Slokdarm- en maagkanker

Impact van COVID-19 op bevolkingsonderzoek darmkanker in Nederland

feb 2021 | Maag-darm-leveroncologie

Lees meer over Impact van COVID-19 op bevolkingsonderzoek darmkanker in Nederland

MedNet Oncologie special Colorectaal carcinoom

sep 2024

Lees meer over MedNet Oncologie special Colorectaal carcinoom

MedNet Oncologie 2024-04

aug 2024

Lees meer over MedNet Oncologie 2024-04

MedNet Oncologie special Borstkanker 2024

jul 2024

Lees meer over MedNet Oncologie special Borstkanker 2024

MedNet Oncologie special Longkanker 2024

jun 2024

Lees meer over MedNet Oncologie special Longkanker 2024

MedNet Oncologie 2024-03

jun 2024

Lees meer over MedNet Oncologie 2024-03

MedNet Oncologie 2024-02

apr 2024

Lees meer over MedNet Oncologie 2024-02

MedNet Oncologie special Uro-Oncologie 2024

mrt 2024

Lees meer over MedNet Oncologie special Uro-Oncologie 2024

MedNet Oncologie 2024-01

feb 2024

Lees meer over MedNet Oncologie 2024-01

MedNet Oncologie 2023-06

dec 2023

Lees meer over MedNet Oncologie 2023-06