Tijdens haar promotieonderzoek aan de Universiteit van Amsterdam onderzocht Natasja Otto de rol van het glucosemetabolisme bij de immuunrespons van monocyten en macrofagen tijdens activering en infectie, in het bijzonder tijdens longontsteking.
Ten eerste onderzocht ze de rol van twee belangrijke mediatoren in het glucosemetabolisme, LKB1 en HIF1α, bij het functioneren van myeloïde cellen, vooral alveolaire macrofagen, tijdens K. pneumoniae-geïnduceerde pneumonie in een muismodel. LKB1-deficiënte dieren hadden een sterk verminderd aantal alveolaire macrofagen in de longen (zo’n 50% minder).
Ook liet ze zien dat HIF1α-deficiëntie in macrofagen, maar niet in neutrofielen, leidt tot een verminderde afweer tegen K. pneumoniae met verhoogde bacterie-aantallen in de longen en andere organen na infectie via de luchtwegen.
In een transcriptomische analyse heeft Otto de metabole routes bepaald die belangrijk zijn voor de activering van humane alveolaire macrofagen door LPS. De alveolaire macrofagen van muizen en mensen bleken na activering geen glycolyse te induceren.