Met behulp van shotgun-metagenomische sequencing hebben onderzoekers uit Hongkong de dynamiek van het darmmicrobioom in kaart gebracht bij personen die na een fecestransplantatie succesvol waren gedekoloniseerd van carbapenem-resistente Enterobacteriaceae, waaronder Klebsiella spp. en Escherichia coli.
Antibioticaresistente darmbacteriën, waaronder carbapenem-resistente Enterobacteriaceae en vancomycine-resistente enterokokken, zijn wereldwijd in opkomst. Fecestransplantatie heeft een potentiële rol bij de dekolonisatie van multiresistente micro-organismen. Er is weinig bekend over de veranderingen in het microbioom bij dragers van multiresistente micro-organismen die een fecestransplantatie krijgen.
Onderzoekers uit Hongkong vonden dat na een fecestransplantatie grote verschuivingen in de bacteriële samenstelling van de feces optraden, die leken op een donorachtige gemeenschap dat werd gedomineerd door het geslacht Ruminococcus.
Twee prominente routes van pentosefosfaat (niet-oxidatieve tak) en de biosynthese van UDP-N-acetylmuramoyl-pentapeptide waren significant hoger bij donoren dan in de situatie voorafgaand aan de fecestransplantatie (p < 0,05). Noemenswaardig is dat de uiteenlopende aanwezigheid van deze twee routes bij personen met carbapenem-resistente Enterobacteriaceae en gezonde personen voornamelijk werd gedreven door de bacteriële geslachten Faecalibacterium en Ruminococcus.
In monsters van de donoren en in ontvangers van een fecestransplantatie werden nauwe interacties tussen het bacterioom en viroom in de darmen vastgesteld. De interacties voorafgaand aan de fecestransplantatie waren duidelijk anders. Dit ondersteunt de gedachte dat een fecestransplantatie van invloed is op de samenstelling van het darmmicrobioom en de interacties tussen de verschillende micro-organismen.
Na een fecestransplantatie trad een substantiële uitbreiding van de Klebsiella-fagen en een overeenstemmende afname van de Klebsiella spp. op. Dit wijst op een roofdier-prooirelatie tussen de bacteriofagen en bacteriën bij de eradicatie van carbapenem-resistente Enterobacteriaceae.
Bij een drager van carbapenem-resistente E. coli trad na de fecestransplantatie een opvallende toename van Escherichia-fagen op. Dit vormt een verdere ondersteuning voor de gedachte dat door een fecestransplantatie een specifieke expansie van bacteriofagen tegen carbapenem-resistente Enterobacteriaceae optreedt.
Concluderend toonde deze studie aan dat een fecestransplantatie resulteerde in een succesvolle dekolonisatie van carbapenem-resistente Enterobacteriaceae.
Bron:
Liu Q, Zuo T, Lu W, et al. Longitudinal evaluation of gut bacteriome and virome after fecal microbiota transplantation for eradicating carbapenemresistant Enterobacteriaceae. UEG Virtual Congress 2021, abstract LB18. https://programme.ueg.eu/week2021/#/details/presentations/4922.